Научная деятельность является одним из основных направлений деятельности НАА и осуществляется в целях обеспечения подготовки специалистов, научных и научно-педагогических кадров на уровне предъявляемых современных требований, для эффективного использования как единой системы учебного, исследовательского и инновационного потенциала Академии.

Основные задачи научной деятельности Академии:

• получение новых знаний, формирование и развитие научных школ и ведущих исследовательских групп по важнейшим направлениям науки и техники;
• обеспечение единства образовательного и научного процесса на основе последних достижений научно-технического прогресса и подготовка высококвалифицированных специалистов и научно-педагогических кадров;
• сохранение и укрепление базового, определяющего характера науки для развития высшего образования;
• создание конкурентоспособных образцов наукоемких продуктов и новых технологий и материалов, ориентированных на высокие технологии;
• развитие инновационной деятельности Академии;
• создание условий для защиты интеллектуальной собственности и авторских прав Академии;
• расширение международного научно-технического сотрудничества с образовательными учреждениями и компаниями зарубежных стран для интеграции в мировую систему науки и образования;
• создание качественно новой опытно-производственной базы в Академии;
• формирование финансовой базы для исследований и разработок с использованием внебюджетных фондов и инновационной деятельности;
• проведение фундаментальных и прикладных научных исследований в приоритетных областях науки;
• изучение и разработка теоретических и методологических основ формирования и развития системы непрерывного образования;
• использование новейших научных достижений и технологий в обучении;
• повышение качества подготовки научно-педагогических кадров на основе использования в учебном процессе важнейших результатов научных исследований, более активное привлечение бакалавров, магистрантов и докторантов к осуществлению научно-исследовательских работ в Академии;
• развитие научных исследований как основы для подготовки высококвалифицированных специалистов в аэрокосмической отрасли и других направлениях деятельности;
• доступ к международным научно-образовательным проектам и инновационным исследовательским программам;
• осуществление актуальных и практически значимых исследовательских проектов, повышение их качества и эффективности;
• подготовка и издание научной, учебной и учебно-методической литературы, руководств, аналитических и других материалов;
• практическое знакомство бакалавров, магистрантов и докторантов с формулировкой и решением научных проблем и привлечение наиболее способных студентов к проведению научных исследований;
• активное участие академии в государственных целевых программах, научных, исследовательских, инновационных программах и конкурсах, грантах, объявленных Министерством образования, другими министерствами и ведомствами, Фондом развития науки, а также иностранными государствами;
• развитие научного сотрудничества с научно-исследовательскими организациями и предприятиями (в том числе, c зарубежными) для совместного решения прикладных проблем;
• обеспечение взаимосвязи научного и учебного процессов, поддержка и развитие студенческой науки;

Академия осуществляет решение вышеперечисленных вопросов через фундаментальные, прикладные научно-исследовательские, опытно-конструкторские, проектные работы, а также реализуя инновационную деятельность.

Финансирование научно-исследовательской и инновационной деятельности осуществляется за счет бюджетов различных уровней, а также внебюджетных средств.

Внебюджетные фонды для финансирования научно-инновационной деятельности:

• средства, полученные Академией от предприятий, организаций и учреждений, для проведения исследований и разработок по хозяйственным договорам;
• Фонд Развития Науки при Президенте Азербайджанской Республики, а также другие фонды;
• специальные гранты, выделяемые международными фондами и организациями;
• внебюджетные средства Академии и другие легальные источники за счет дополнительных образовательных услуг.

В научно-исследовательской деятельности Академии участвуют:

• профессорско-преподавательский состав в соответствии с индивидуальными планами работы;
• научные, инженерно-технические работники, специалисты и сотрудники научных отделов Академии;
• предусмотренные учебными планами студентов курсовые работы, выпускные работы, другие исследовательские работы в Доме творчества студентов НАА и других лабораториях студенческого научного творчества, а также на кафедрах, в исследовательских отделах, Научно-Исследовательском Институте при Академии.
• магистранты, докторанты (диссертанты), исследователи Академии в соответствии с индивидуальными планами работы, а также на кафедрах, в Научно-Исследовательском Институте, в нерабочее время с доплатой.